Según una posible hipótesis sobre la etimología de este topónimo, procedería del nombre latino [villa] Gaiena, «la villa de Gayo», a través de la forma árabe Jayyān que se usaba durante la época musulmana. Existe también la versión, por parte de algunas familias judeo sefardíes del norte de África, de que tanto su apellido como su ciudad de origen, refiriéndose a Jaén, tiene su origen en la palabra hebrea Dayan, que significa "juez" en hebreo y derivaría en Yayyan o Djayyan. Es conveniente recordar, no obstante, que el nombre con el que se conocía a la ciudad, capital de la cora de Yayyán, en la época del emirato, era Hadira.